Ερωτηθείσα αναφορικά με την μετατροπή της Αγίας Σοφίας σε τζαμί, η κ. Μπακογιάννη σε συνέντευξη της στα Παραπολιτικά 90,1 και στην εκπομπή «Καινούργια μέρα» με τον δημοσιογράφο Δημήτρη Τάκη σημείωσε πως «αποτελεί προσβολή προς τη χριστιανική πίστη και προσβολή προς οποιανδήποτε πολιτισμένο άνθρωπο που δεν θα έχει την δυνατότητα να απολαύσει ένα παγκόσμιο μνημείο που ανήκει στον κόσμο».
Η βουλευτής της ΝΔ τόνισε πως «ο Τούρκος πρόεδρος Ερντογάν δεν χαρακτηρίζεται από την σταθερότητα του στην πολιτική και πως η διεθνής κοινότητα δεν μπορεί να ξεγράψει την Τουρκία», σημειώνοντας πως «πρέπει να παλεύεις για τον φέρεις σε ένα λογαριασμό και μια συνεργασία».
Σημείωσε παράλληλα πως «έχει γίνει αντιληπτό σε πολλούς ότι τα ελληνικά σύνορα είναι σύνορα της Ευρώπης» και ανέφερε πως «η Ελλάδα είναι σε ετοιμότητα απέναντι στις τουρκικές προκλήσεις μετά και την navtex κοντά στο Καστελόριζο».